个人办理医疗机构许可证的方式是向县卫生局提交《医疗机构执业许可证》申请报告，并提供医疗机构用房产权证明或者使用证明等相关的资料。若是审核通过的，则发放许可证。
《医疗机构管理条例》第十县级以上地方卫生行政部门自受理执业登记申请之日起45日内，根据本条例和医疗机构基本标准进行审核。审核合格的，予以登记，发给《医疗机构执业许可证》；审核不合格的，将审核结果以书面形式通知申请人。《医疗机构管理条例》第三条医疗机构以救死扶伤，防病治病，为公民的健康服务为宗旨。